Nowy urząd przejąłby także kompetencje Inspekcji Handlowej związane z nadzorem nad żywnością. Zacznie działać prawdopodobnie od 1 stycznia 2008 roku.
Będzie to już drugi projekt dotyczący Państwowej Inspekcji Bezpieczeństwa Żywności. Pomysł na jego powołanie związany jest z realizacją przez PiS programu „Tanie państwo”. Poprzedni, który ujrzał światło dzienne w połowie ubiegłego roku, wzbudził wiele kontrowersji w urzędach wytypowanych do połączenia. Stanowcze „nie” powiedziała Państwowa Inspekcja Sanitarna podległa ministrowi zdrowia. W Państwowej Inspekcji Bezpieczeństwa Żywności byłoby znaleźć się jej dział odpowiedzialny za bezpieczeństwo żywności.
Urzędnicy przekonywali, że nowy urząd nie będzie w stanie samodzielnie przeprowadzać wszystkich badań. Na przykład te dotyczące skażenia żywności będzie i tak musiał zlecać Państwowej Inspekcji Sanitarnej. Ich argumenty zostały wysłuchane – inspekcja ta nadal będzie niezależnie kontrolować żywność.